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種子質量是指種子這種特殊商品滿足人們使用種子所要求的特征特性的總和。狹義的種子質量指種子的自身品種品質和播種品質包括真實性、品種純度（用種子風選儀進行純度的選擇）、凈度、發芽力和生活力、千粒重（可能會使用到數粒儀或者電子自動數粒儀）、病蟲感染率、水分百分率、種子活力等8個方面分別簡稱為“真、純、凈、飽、壯、健、干、強”；廣義的種子質量包括物理質量、生理質量、遺傳質量、病理質量和產品質量其中產品質量包括包裝、標簽、表識、外觀等外延因素。

國家把關系國計民生、對人民群眾生產生活有極大影響、栽培面積比較廣的農作物確定為主要農作物《中華人民共和國種子法》規定水稻、小麥、棉花、玉米、大豆為主要農作物農業部將馬鈴薯和油菜也規定為主要農作物。對主要農作物種子國家制定了強制質量標準并規定必須印刷或制成印刷品固定在包裝物表面。現行雜交水稻種子質量標準為 GB4404.1-1996其中2級種子質量標準為：水分≤13%凈度≥98%發芽率≥80%純度≥96%。一般來講在以上4個方面均達到國家標準的雜交水稻種子視為合格種子。

綜合《中華人民共和國種子法》及其配套法律法規中的有關規定種子質量問題包含的范圍更為廣泛它是指由于種子質量低于種用標準（主要農作物種子為國家強制標準）或者標簽標注內容、含有國家規定檢疫對象（即有害生物）和在不符合國家或地方規定的投放區域使用所造成的產量損失和質量影響。非種子質量問題是指除上述原因以外由氣候、環境和人為等因素造成的產量損失和質量影響。