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在現代，為了保證農業種植的質量和水平，因此對于種子的要求分廠高，因此在進行種子檢測的時候，專業的種子檢測實驗室會按照檢測流程分為五個區域，分別為芽率檢測區、水分檢測區、凈度檢測區、純度檢測區、樣品儲藏區、產品農殘檢測區，下面來分別說明。

芽率檢測區：對種子進行發芽盒子及土壤的芽率檢測。主要儀器包括置床儀，智能光照培養箱，進行種子預冷處理的冰箱等。

水分檢測區：烘箱標準法或快速水分檢測儀器測定種子的水分。主要儀器包括烘箱、電動粉碎機、干燥器，快速水分檢測儀，天平等。

凈度檢測區：對種子清潔干凈程度的分析。儀器包括種子凈度工作臺、分析天平等。

純度檢測區：對種子或者植株進行品種純度的形態測定和電泳測定。主要在中央試驗臺區域。儀器包括雙穩時電泳儀、水平電泳槽、生物顯微鏡，天平2臺等。

樣品儲藏區：對不同的種子批扦取的樣品，使用前和使用后均需做好標記后封緘放入樣品庫保存。主要儀器包括低溫低濕儲藏柜一臺，扦樣器、分樣器等若干。

農殘檢測區：對農場生產的蔬菜進行農藥殘留檢測，符合標準的才允許出售。主要儀器包括電腦、殘留農藥測試儀，試管、燒杯、移液管等若干。